在研究克罗恩病(一种胃肠道炎症性疾病)的领域,一个重要的问题是如何将其致病原因与该病症中固有的全身性炎症反应分开。对此,医学博士Subra Kugathasan领导的研究人员最近发表了一项分析,研究了炎症迹象,以评估可能的原因。
Kugathasan实验室的研究生Hari Somineni与埃默里和乔治亚理工学院的遗传学家合作,采用了一种复杂的方法进行探究。结果发表在Gastroenterology杂志上。
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该小组研究了患有克罗恩病的儿科患者血液样本中的DNA甲基化情况,包括诊断和治疗后及随访。这些信息来自164名患有克罗恩病的儿童和74名对照的血液样本。
“我们的研究强调了进行纵向剖析,观察治疗前后患者的重要性,而不是仅仅采取横断面,”Somineni说。
DNA甲基化是一个动态过程,可以通过打开或关闭基因来影响复杂疾病的分子表型。研究人员观察到,儿童克罗恩病患者在诊断时破坏的甲基化模式在治疗炎症后恢复到类似对照组。
Kugathasan是马库斯亚特兰大埃默里大学医学院和儿童保健学院的儿科和人类遗传学教授,也是儿童移植和免疫介导疾病中心的主任。 Somineni是遗传学和分子生物学系的研究生。
作者写道,血液中绝大多数与疾病相关的甲基化变化“是炎症的短暂后果,因而是疾病的结果”。 “我们所看到的是炎症特征的治疗可能从根本上治疗克罗恩病的症状,而不是原因。”他们补充说:“这可能至少部分解释了为什么克罗恩病通常仍然是终身缓解和复发疾病,尽管有效治疗炎症症状。”
由于样本来自患者的血液,而不是他们的肠子。因此,白细胞中的基因主要提供有关全身性炎症水平的信息是有道理的,这些信息在成功治疗后会降低。 Somineni说,从肠道组织或位于肠道的免疫细胞中取样可能会产生不同的结果。
研究人员采用“孟德尔随机化”分析方法,以描绘可能导致疾病或由疾病引起的甲基化变化。这使他们能够消除炎症,揭示可能成为疾病发展的甲基化变化;这些甲基化变化似乎介导已知非编码变体(单核苷酸多态性或SNP)的遗传风险。将甲基化数据与现有遗传信息整合已经指出了编码核糖体蛋白S6激酶A2的基因RPS6KA2 - 一个Somineni计划进一步研究的基因。
资讯出处:Sifting through signs of inflammation to analyze causes of Crohn's disease
原始出处:Hari K. Somineni et al. Blood-derived DNA Methylation Signatures of Crohn's Disease and Severity of Intestinal Inflammation, Gastroenterology (2019). DOI: 10.1053/j.gastro.2019.01.270